Był jednym z najważniejszych reformatorów XVI wieku. Jego nauczanie stworzyło fundament dla Kościołów reformowanych i wywarło trwały wpływ nie tylko na historię religii, lecz także na kulturę, politykę i życie społeczne wielu krajów Europy i Ameryki.
Był twórcą "Institutio religionis christianae", pierwszego traktatu teologicznego przedstawiającego teologię protestancką. Na jego podstawie wykształcił się kalwinizm.
Obok Lutra i Zwingliego, stał się filarem protestantyzmu, jego idee ukształtowały Kościoły reformowane w Szwajcarii, Francji, Holandii i Szkocji, a także hugenocką tożsamość we Francji, purytanizm w Anglii i wśród osadników w Ameryce.