Jeśli chodzi o środowisko, niewątpliwym plusem inwestycji jest optymalizacja i racjonalizacja przepływów oraz zabezpieczenie przed ekstremalnymi zjawiskami hydrologicznymi, jak powodzie czy susza. W tej kwestii więcej jest jednak negatywnych skutków: różne rodzaje powodzi na Jangcy - wylewa cała rzeka
powodzie w górnym biegu
powodzie w środkowym i dolnym biegu
zwiększona sedymentacja osadów, co obniża zdolność do zatrzymywania wielkich wód
poświęcenie potrzeb ochrony na rzecz produkcji energii
prawdopodobne wyginięcie około 50 rzadkich, niekiedy endemicznych gatunków flory i fauny (np. złota małpa, panda olbrzymia, chiński delfin rzeczny, żuraw syberyjski, aligator Jangcy, jesiotr chiński)