Od 1535 roku wchodziła w skład wicekrólestwa Nowej Hiszpanii, od 1717 w skład wicekrólestwa Nowej Granady, a po wyzwoleniu spod panowania Nowej Granady w 1819 roku weszła w skład Wielkiej Kolumbii, jako jej prowincja. Od 1830 roku Panama należała do Kolumbii.
Z inspiracji USA w 1903 roku Panama oderwała się od Kolumbii i utworzyła odrębną republikę. USA uzyskało wieczystą dzierżawę Strefy Kanału Panamskiego i prawo stacjonowana na terenie kraju wojsk amerykańskich.
Podczas II wojny światowej na terenie Panamy utworzono amerykańskie bazy wojskowe.