W okresie panowania Totmesa II rzeczywistą władzę sprawowała Hatszepsut. 

Totmes II panował prawdopodobnie trzynaście lat (niektóre źródła wskazują 3 lat, inne 18 lat), ale uważa się, że rzeczywistą władzę sprawowała jego żona, która zajmowała się najważniejszymi sprawami państwa. Dowodem na to może być stela umieszczona przez architekta i wysokiego urzędnika państwowego Ineni w jego grobowcu w Szeich Abd el Gurna, mówiąca: „...Król wstąpił do nieba i połączył się z Bogami. Jego syn zajął jego miejsce jako król Obu Krajów i był władcą na tronie tego co go spłodził. Jego siostra, Boska Małżonka Hatszepsut zajmowała się sprawami kraju; ona rządziła Obojgiem Krajów, jej płacono podatki...”