Odkrył lizozym i penicylinę. W czasie I wojny światowej był lekarzem w korpusie medycznym, co pogłębiło jego zainteresowanie infekcjami i ich leczeniem.
W 1945 roku wraz z Ernstem Chainem i Howardem Floreyem otrzymał Nagrodę Nobla w dziedzinie medycyny za odkrycie penicyliny i jej leczniczego działania w różnych chorobach zakaźnych.
Zmarł 11 marca 1955 roku, jego grób znajduje się w katedrze św. Pawła w Londynie – co jest wielkim wyróżnieniem w Wielkiej Brytanii.
