Problemy z zachowaniem nie są na ogół tak wielkim problemem, jak w przypadku innych zespołów związanych z niepełnosprawnością intelektualną. U dzieci z zespołem Downa choroba psychiczna występuje u prawie 30%, a autyzm u 5-10%. Osoby z zespołem doświadczają szerokiej gamy emocji. Na ogół są szczęśliwe - objawy depresji i lęku mogą rozwinąć się we wczesnej dorosłości.
