Mężczyźni z zespołem Downa zwykle nie płodzą dzieci, podczas gdy kobiety mają niższy wskaźnik płodności w porównaniu z osobami zdrowymi - szacuje się, że płodność występuje u 30-50% kobiet.
Menopauza zwykle występuje w młodszym wieku. Uważa się, że słaba płodność u mężczyzn jest spowodowana problemami z rozwojem plemników, jednak może to być również związane z brakiem aktywności seksualnej. W 2006 roku zgłoszono trzy przypadki ojcostwa dzieci przez mężczyzn z zespołem Downa i 26 przypadków kobiet mających dzieci. Bez technologii wspomaganego rozrodu, około połowa dzieci osób z zespołem Downa również będzie miała ten zespół.