Substancja ta ma przede wszystkim wpływ na funkcjonowanie wątroby. Posiada właściwości żółciotwórcze i żółciopędne, dzięki czemu ułatwia trawienie pokarmów, pobudza regenerację wątroby, przeciwdziała jej stłuszczeniu. Cynaryna działa również przeciwzapalnie i przeciwbakteryjnie.