Kościół powstał na rozkaz Ludwika XII, króla Francjii, będącego właścicielem gruntu (wcześniej znajdowała się tu rozległa winnica). Prace budowlane trwały prawie przez cały XVI wiek. Kościół wybudowano w stylu gotyckim z kamienia z Narbony (miejscowość we Francji). Konsekracji dokonał w 1585 roku papież Sykstus V. Aby połączyć wzgórze Pincio z bazyliką Santa Maria Maggiore nakzano zbudowanie drogi. Po wybudowaniu jej okazało się, że leży ona niżej niż kościół. Aby temu zapobiec, architekt zaprojektował i zbudował dwubieżne schody z dwoma tarasami, prowadzące do kościoła.
