Można tutaj odnaleźć rozmaite gatunki storczyków o zachwycającej kolorystyce. Na terenach skalnych rosną takie rośliny, jak sesleria skalna czy smagliczka skalna. W lasach pienińskich z kolei można znaleźć liczne pierwiosnki, przebiśniegi, śnieżyczki. W Pienińskim Parku Narodowym rosną również rośliny, które odnaleźć można w innych kompleksach górskich, m.in. w Bieszczadach (np. tawuła średnia).
