Toczyli wojnę z Peru i Chile, lecz w 1879 roku zmuszeni byli uznać niepodległość kraju. Na przestrzeni dziejów Peru toczyło też liczne wojny ze swoimi sąsiadami. Najistotniejszą z nich była tzw. "wojna o saletrę" (wojna o Pacyfik) pomiędzy Chile i połączonymi siłami Boliwii i Peru. Wojna zakończyła się zwycięstwem Chile, które zdobyło terytorium bogate w surowce mineralne i odcięło Boliwii dostęp do Pacyfiku. Peru straciło wówczas swoja prowincję Tarapaca, która obfitowała w saletrę. Ta przegrana spowodowała upadek gospodarczy Peru.