Symbolem parku i jego największą atrakcją jest waran z Komodo (Varanus komodoensis).

Jest to największa jaszczurka na świecie i jeden z największych na świecie gadów. Gorący i suchy klimat z sawannową roślinnością jest doskonałym siedliskiem dla warana z Komodo, który jest gatunkiem endemicznym parku.

Istnieją plany przyłączenia do parku dwóch kolejnych wysp: Banta i Gili Motong, do których coraz częściej dopływają warany. Wyspy te nie są objęte ochroną i przebywające tam gady narażone są na polowania kłusowników.