Największym problemem Serengeti jest kłusownictwo.

Szacuje się, że każdego roku łupem kłusowników pada od 90 do 140 tysięcy zwierząt (dane organizacji Serengeti Watch). Kłusownicy niemal całkowicie wytępili nosorożce i znacznie ograniczyli populację guźców, żyraf, bawołów i kilku gatunków antylop.

Jednym z pierwszych strażników parku był Myles Turner, który w ciągu szesnastu lat pracy znacznie ograniczył kłusownictwo w Serengeti. Opracował wykorzystanie samolotów w zarządzaniu parkiem i kierował szkoleniami wielu tanzańskich strażników.