Sobieski ufundował też kościół kapucynów i kościół św. Kazimierza na Nowym Mieście w Warszawie, a także kaplicę Królewską w Gdańsku.
W kościele kapucynów, ufundowanym jako votum za wiktorię wiedeńską, w kaplicy królewskiej bł. Anioła z Akry, spoczywa serce króla.