Przez długi czas żyjąca tam ludność tworzyła jedynie społeczności w obrębie plemiennych wiosek. Pierwsze wielkie cywilizacje zaczęły powstawać około 1500 lat temu. Jedną z nich była cywilizacja Marajoara, która zaczęła się rozwijać około 3000 lat temu a jej dynamiczny rozkwit nastąpił nastąpił w latach 800 - 1400 n.e. Upadek amazońskich cywilizacji wiąże się ściśle z europejską kolonizacją tych terenów.