Jest jednym z najpowszechniejszych owadów na ziemi. Znaleźć ją można prawie w każdym zakątku planety. Uważa się, że gatunek muchy domowej powstał na obszarach Bliskiego Wschodu we wczesnym kenozoiku, okresu zaczynającego się 66 milionów lat temu i trwającego do dzisiaj. Po całym globie mucha domowa rozprzestrzeniła się dzięki migracji i osadnictwu ludzkiemu.